درس المرحلة الابتدائية و المتوسطة في المدارس الحكومية.
التحق بالحوزة العلمية في السابعة عشر من عمره، فدرس المقدمات عند أساتذة الحوزة المشهورين و البارزين.
هاجر إلى لبنان لأسباب سياسية و أمضى حوالي 5 سنوات في بيروت و قام هناك بأعمال ثقافية فنشط في إلقاء المحاضرات و كتابة المقالات الدينية في المجلات و الصحف الإسلامية مثل: العرفان و الحياة.
هاجر إلى البحرين و بعد توقف دام تسعة أشهر و قيامه بإلقاء المحاضرات باللغتين العربية و الفارسية في المجالس الدينية و الاجتماعية، و كتابة و نشر المقالات، و إلقاء محاضرات في إذاعة المنامة في المناسبات الدينية الشيعية، انتقل إلى الجمهورية الإسلامية الايرانية ليقيم فيها.
في عام 1359هـ التحق الشيخ جعفر الهادي بحوزة قم فدرس عند علمائها و مراجعها العظام و درَّس في حوزاتها المختلفة حتى صار علماً من أعلامها المشهورين.
ألقى محاضرات كثيرة و له مقابلات عديدة باللغتين العربية و الفارسية ــ حيث كان يتقنهما جيداً ــ حول مختلف القضايا الإسلامية و الاجتماعية في القنوات الإذاعية الوطنية و العربية و الفارسية و قناة القرآن الكريم و المحطات الإذاعية المحلية في ايران، كما بثت محاضراته على قناة المنار.
اشتغل بالتدريس في جامعة الشريف للتكنولوجيا في طهران، و جامعة الزهراء، و مؤسسة المذاهب الإسلامية، و كلية الشهيد محلاتي في قم. كما كان المرحوم عضواً في هيئة التدريس في المجمع العالمي لأهل البيت عليهم السلام ، و بعثة الإمام الخامنئي، و جامعة أهل البيت عليهم السلام العالمية ، و أمين لجنة الدعوة و التعليم للدرجات العلمية للحوزة.
معالم الحكومة الاسلامية / عربى/ ترجمة محاضرات آية الله الشيخ جعفر السبحاني
العقيدة الاسلامية فى ضوء مدرسة اهل البيت(ع)/ عربى / ترجمه منشور عقائد اماميه تأليف الشيخ جعفر السبحاني- والشيخ بيشوائي
دروس من الثقافة الاسلامية 3 مجلدات / ترجمة
الامثل في تفسير كتاب الله المنزل / ترجمه المجلد 1 و 3 من كتاب تفسير نمونه لآية الله مكارم الشيرازي
توفي صباح يوم الخميس 17 ربيع الثاني سنة : 1442هـ عن عمر يناهز 76 عامًا إثر نوبة قلبية ، وصلّى على جثمانه المرجع الديني حسين النوري الهمداني ، و دُفن بجوار مرقد السيّدة فاطمة المعصومة عليها السلام .
ظاهرة الإمامة المبكرة، وتسلم مقاليد الإمامة والتكليف بها وهو في سن مبكرة جدا، فهل لها سوابق تاريخية بين الانبياء والرسل والاولياء الصالحين ؟ حيث نجد ان الإمام بعد ان يعيش خمس سنوات في ظل والده الإمام الحسن العسكري عليه السلام وثم يتوفى شهيداً، يتسلّم المهدي عليه السلام زمام الامور، وكل المؤرخين تقريبا الذين ارخوا للإمام الحسن العسكري عليه السلام الذي كان يسمى بالخالص ايضا قالوا ان ليس له الا ولد واحد وهو محمد وقالوا ان هذا البعض هو الإمام المهدي عليه السلام.
﴿ ... وَجَعَلْنَاكُمْ شُعُوبًا وَقَبَائِلَ لِتَعَارَفُوا ... ﴾ 1 جاء الإسلامُ و الشعوبُ متفرّقة متناکرة ، بل و متصارعة متناحرة ، و لکن سرعانَ ما حلّ التعارفُ محلّ التناکر ، و التعاونُ محلّ التخاصم ، و التواصل محلّ التدابر ، بفضل تعاليم الإسلام التوحيديّة ، فکانت المحصّلة أن ظَهرتْ إلى الوجود تلك الأُمّة الواحدةُ العظيمة التي قدّمت ذلك العطاء الحضاري العظيم ، کما و حَمَت شعوبها من کلّ غاشم و ظالم و صارت تلك الأُمّة المحترَمةُ بين شعوبِ العالَم و تلك الکتلة المُهابة في عيون الطغاة و الجبّارين .
الكتاب عرض موجز لأبرز الخطوط في مجال العقيدة و الشريعة عند الشيعة الإمامية المسمّاة بالجعفريّة ، قام بتأليفه سماحة الاستاذ الشيخ جعفر الهادي ( رحمه الله ) .
كتاب " السيدة فاطمة الزهراء عن لسان عائشة زوجة رسول الله ( صلى الله عليه و آله ) " هو مجموع ما روته زوجة النبي المصطفى ( صلى الله عليه و آله ) في سيدة النساء فاطمة الزهراء ( عليها السلام ) ، و قد قام العلامة الشيخ جعفرالهادي ( رحمه الله ) بجمعه و تبويبه و التعليق عليه .